Molby
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Molby
対話型分子モデリングソフトウェア
(Ruby インタプリタ内蔵)
Version 1.2beta1
永田 央
https://toshinagata.github.io/Molby/ja
目次
はじめに
Molbyとは?
インストール
著作権とライセンス
チュートリアル
第一段階:新しい分子を描く
第二段階:分子を編集する
第三段階:分子を編集する:カット・コピー・ペースト
第四段階:縮環構造の作成
第五段階:分子を編集する:属性テーブルを使う
第六段階:分子力学計算によるエネルギー最小化
第七段階:分子動力学計算
第八段階:配位化合物のMM/MD計算
第九段階:他の量子化学ソフトウェアとの連携
第十段階:結晶構造を取り扱う
第十一段階:組み込み Ruby インタプリタを使う
付録
Ruby 拡張リファレンス
Filter Kit の使い方
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